Corrélations entre les sites de mutation APC germinale et les pathophénotypes colorectaux, telles qu’évaluées par le comptage direct des adénomes lors de la colectomie, ont été étudiées en analysant les spécimens de colectomie de 29 patients FAP porteurs d’une mutation faux-sens (codon 208) et de 14 mutations APC de type frame-shift ou non-sens (codons 232, 367, 437, 623, 876, 995, 1061, 1068, 1075, 1112, 1114, 1309, 1324, 1556). La mutation faux-sens au codon 208 était associée à un pathophénotype colorectal relativement léger. La mutation au codon 367, soumise à un épissage alternatif, était associée à une PAF atténuée. La mutation au codon 1309 était associée à l’adénomatose colorectale profuse. Pour 13 mutations, dont on prédit qu’elles entraînent des allèles nuls ou des protéines APC tronquées, nous avons corrélé la densité et la distribution des adénomes colorectaux avec les effets fonctionnels prédits de la mutation. Le pathophénotype colorectal le plus sévère était significativement associé à la mutation tronquée au codon 1309, qui est située en aval du domaine de liaison de la bêta-caténine I mais en amont du domaine de liaison de la bêta-caténine II. Les mutations entre les codons 867 et 1114, qui affectent le domaine de liaison de la bêta-caténine I, ainsi que les mutations survenant dans les exons 6 et 9, prédites pour donner des allèles nuls, étaient associées à un pathophénotype colorectal moins sévère. Dans l’ensemble, le plus grand nombre d’adénomes a été détecté dans le côlon droit, suivi par le côlon gauche, le côlon transverse sigma et le rectum. Cependant, la plus forte densité d’adénomes a été observée dans le côlon gauche, suivi du côlon droit, du sigma, du côlon transverse et du rectum. Les carcinomes colorectaux, observés chez seulement cinq patients, se trouvaient tous dans le côlon gauche.