A dél-amerikai ló ősi állománya az andalúziai és más ibériai vérvonalú spanyolok által a nyugati féltekére hozott lovaktól származik. A kontinens déli részén e lovak jelentős része földrajzilag elszigetelt körülmények között fejlődött ki, és a 19. század közepén már tetszőleges számú kisebb, beltenyésztett állat volt a Buenos Aires déli részén, az argentin Olavarríában található Buenos Aires tartomány Mapuche-csordáiban. A falabella lovat eredetileg Argentínában fejlesztették ki a helyi criollo állományú lovakból, 1868-ban Patrick Newtall tenyésztési programjával kezdődően. Amikor Newtall meghalt, a ménes és a tenyésztési módszerek Newtall vejére, Juan Falabellára szálltak. Juan további vérvonalakat adott hozzá, beleértve a walesi pónit, a shetlandi pónit és a kis telivéreket. Jelentős beltenyésztéssel sikerült a csordán belül következetesen kis méreteket elérnie.
Az 1940-es évektől kezdve egy leszármazottja, Julio C. Falabella, hivatalos fajtanyilvántartást hozott létre, az Establecimientos Falabella, ma Asociación de Criadores de Caballos Falabella (Falabella Lótenyésztők Egyesülete), és a fajta szabványosításán dolgozott, hogy egységes magasságot érjen el, először 100 cm (40 in) alatti átlagméretet elérve.
Később a tenyésztők kidolgozták a modern standardot, egy olyan lófajtát, amely átlagosan körülbelül 76 cm (30 in) magas.