A Tenure of Office Act korlátozta az elnök azon jogát, hogy a szenátus ülésszünetében felfüggesszen egy tisztviselőt. (Abban az időben a kongresszus az év viszonylag kis részében ülésezett.) Ha a szenátus újra összeült, és elutasította a felmentés megerősítését, az elnöknek vissza kellett helyeznie a tisztviselőt.
1867 augusztusában, amikor a szenátus nem ülésezett, Johnson lépett Stanton ellen, és felfüggesztette őt a szenátus következő üléséig. Amikor a szenátus 1868. január 13-án összeült, 35-6-os szavazati aránnyal azonban elutasította az eltávolítás ratifikálását. A szavazás ellenére Johnson elnök Ulysses S. Grant tábornokot nevezte ki hadügyminiszternek, mert ezzel az intézkedéssel olyan ügyet akart teremteni, amelyen keresztül a Legfelsőbb Bíróság előtt megtámadhatja a törvény jogszerűségét. Napokon belül megindult a Johnson elleni vádemelésre irányuló eljárás, amely az első vádemelés volt az Egyesült Államok elnöke ellen. A három hónapos tárgyalás után Johnson egyetlen szavazattal elkerülte, hogy a szenátus eltávolítsa hivatalából. Stanton 1868 májusában lemondott.
Nagyon tisztázatlan volt, hogy Johnson megsértette-e a Tenure of Office Actet, ami a vádemeléshez vezetett. A törvény megfogalmazása homályos volt, és nem volt világos, hogy Stanton (a Lincoln-kormányzatból visszamaradt személy, akit Johnson nem nevezett ki) eltávolítása sértette-e a törvényt. Bár a törvény, megfogalmazása szerint, a hivatalban lévő tisztségviselőkre vonatkozott, a kabinet tagjainak nyújtott védelmet az új elnök hivatalba lépését követő egy hónapra korlátozta.
A konföderációs alkotmány egyértelműbben rendelkezett a szövetségi kormány végrehajtó hivatalainak eltávolításáról. Úgy rendelkezett, hogy “he principal officer in each of the Executive Departments , and all persons connected with the diplomatic service, may be removed from office at the pleasure of the President”. A végrehajtó minisztérium minden más polgári tisztviselőjét csak akkor lehetett eltávolítani, “ha szolgálatuk szükségtelenné vált, vagy tisztességtelenség, alkalmatlanság, eredménytelenség, kötelességszegés vagy kötelességmulasztás miatt, és ha így történt, az eltávolításról a szenátusnak az indoklással együtt jelentést kell tenni.”
Miatt a nézeteltérés miatt, hogy a Tenure of Office Act sérti-e az Egyesült Államok alkotmányát, a helyes eljárás nem az lett volna, hogy az elnököt vád alá helyezik, hanem az, hogy Stanton beperli az elnököt jogtalan elbocsátásért és elmaradt fizetésért, ahogy az a későbbi Myers kontra Egyesült Államok ügyben történt.