Înainte de cel de-al Doilea Război MondialEdit
În 1769, o expediție spaniolă condusă de căpitanul Gaspar de Portolá a explorat spre nord de la Loreto, Baja California Sur, încercând să ajungă la Golful Monterey, ceea ce nu mai fusese făcut niciodată de europeni pe uscat. La data de 20 iulie a aceluiași an, expediția a ajuns în zona cunoscută în prezent sub numele de Camp Pendleton și, întrucât era ziua sfântă a Sfintei Margareta, au botezat ținutul cu numele de Santa Margarita. Expediția a continuat să înființeze avanposturi militare și misiuni franciscane la San Diego și Monterey.
În următorii 30 de ani, au fost înființate 21 de misiuni, cea mai productivă fiind Misiunea San Luis Rey, chiar la sud de actualul Camp Pendleton. În acel moment, Misiunea San Luis Rey deținea controlul asupra zonei Santa Margarita.
După 1821, în urma Războiului de Independență al Mexicului față de Spania, unii dintre foștii membri ai expediției Portolà care au rămas (majoritatea soldați de garnizoană) au primit mari concesiuni de terenuri (ranchos) de la guvernatorii mexicani. Soldaților retrași li s-au alăturat ca rancheros oameni de afaceri, funcționari și lideri militari proeminenți. Aceștia și copiii lor, californienii, au devenit nobilimea funciară din Alta California.
În 1841, doi frați, Pio Pico și Andrés Pico, au devenit primii proprietari privați ai Rancho Santa Margarita. Mai târziu, mai multe terenuri au fost adăugate la concesiune, dându-i numele de Rancho Santa Margarita y Las Flores, care a rămas cu ranch-ul până când Corpul pușcașilor marini l-a achiziționat în 1942. Desenul mărcii de vite a ranchului este văzut astăzi în logo-ul bazei.
În 1863, un englez pe nume John (Don Juan) Forster (cumnatul lui Pio Pico) a plătit datoriile de joc ale lui Pico în schimbul actului de proprietate al ranchului. În timpul mandatului său de proprietar al ranchului, a extins casa de la ranch, care a fost construită pentru prima dată în 1827, și a dezvoltat ranchul într-o industrie prosperă a vitelor.
Emergătorii lui Forster au fost însă nevoiți să vândă ranchul în 1882 din cauza unui șir de ghinioane, care a inclus o serie de secete și o lege a gardurilor care l-a obligat pe Forster să construiască garduri în jurul terenurilor extinse ale ranchului. Ferma a fost cumpărată de bogatul crescător de vite James Clair Flood și a fost administrată de irlandezul Richard O’Neill, care a fost în cele din urmă recompensat pentru serviciile sale credincioase cu jumătate din proprietate. Sub îndrumarea fiului lui O’Neill, Jerome, ranch-ul a început să obțină un profit de aproape jumătate de milion de dolari anual, iar casa a fost modernizată și mobilată până la forma actuală.
Al Doilea Război MondialEdit
La începutul anilor 1940, atât armata, cât și Corpul Pușcașilor Marini căutau teren pentru o bază mare de antrenament. Armata și-a pierdut interesul pentru acest proiect, dar în februarie 1942 s-a anunțat că cei 122.798 de acri (497 km2) din Rancho Santa Margarita y Las Flores urmau să fie transformați în cea mai mare bază a Corpului de Marină din țară. Aceasta a fost botezată în cinstea generalului-maior Joseph Henry Pendleton, care milita de mult timp pentru înființarea unei baze de antrenament pe Coasta de Vest. Construcția a început în aprilie, dar baza a fost considerată o instalație temporară, așa că a fost construită conform standardelor minime de construcție cu structură din lemn. După cinci luni de activitate frenetică de construcție, Regimentul 9 de pușcași marini, sub comanda colonelului de atunci Lemuel C. Shepherd Jr. a mărșăluit de la Camp Elliott din San Diego la Camp Pendleton pentru a fi primele trupe care au ocupat noua bază. La 25 septembrie 1942, președintele Franklin D. Roosevelt a inaugurat oficial baza. Facilitățile de instruire pe timp de război de la bază au inclus școala de ambarcațiuni de debarcare, școala de tractoare amfibii, școala batalionului de plajă, școala de comunicații amfibii și o școală de servicii medicale de teren la spitalul naval de la Santa Margarita Ranch. Această facilitate a fost, de asemenea, folosită ca bază pentru externarea soldaților care se întorceau din Europa și Asia după încheierea celui de-al Doilea Război Mondial în 1945, precum și pentru procesarea documentelor de externare a acestora pentru același lucru.
Post-Secundul Război MondialEdit
În timpul Războiului din Coreea, 20 de milioane de dolari au ajutat la extinderea și modernizarea facilităților existente, inclusiv la construirea Camp Horno. Când Camp Pendleton a antrenat forțele de luptă ale țării pentru războaiele din Coreea și Vietnam, aproximativ 200.000 de pușcași marini au trecut prin bază în drumul lor spre Orientul Îndepărtat.
Începând cu 1954, Camp Pendleton a găzduit o variantă de familiarizare a antrenamentului de bază pentru adolescenții cu vârste cuprinse între 14 și 17 ani. Acest antrenament, numit „Devil Pups”, promovează condiția fizică, insuflă disciplină și promovează dragostea față de țară și față de Corpul pușcașilor marini.
În grajdurile taberei sunt expuse o placă și o statuie care comemorează un cal, Sergentul Reckless, care a servit alături de Corpul pușcașilor marini în Coreea.
În 1975, Camp Pendleton a fost prima bază militară din SUA. care a oferit cazare pentru evacuații vietnamezi în cadrul Operațiunii New Arrivals; peste 50.000 de refugiați au venit la bază în cel mai mare transport umanitar aerian din istorie.
Camp Pendleton a continuat să se dezvolte prin renovări, înlocuind taberele de corturi inițiale cu peste 2.626 de clădiri și peste 500 de mile de drumuri.
Eforturile continuă și astăzi pentru a păstra moștenirea fondatorilor de la Camp Pendleton și istoria Corpului Pușcașilor Marini. Casa originală de la fermă a fost declarată sit istoric național, precum și Las Flores Adobe.
Secolul XXIEdit
Geografia diversă a bazei, care se întinde pe o suprafață de peste 125.000 de acri (506 km2), găzduiește pe tot parcursul anului antrenamente pentru pușcașii marini, pe lângă toate celelalte ramuri ale armatei americane. Antrenamentul amfibiu și de la mare la țărm are loc în mai multe puncte cheie de-a lungul celor 17 mile (27 km) de coastă ale bazei. Baza principală se află în complexul Mainside, la capătul sud-estic al bazei, iar interiorul nordic îndepărtat este o zonă de impact. Populația din timpul zilei este de aproximativ 100.000 de persoane. Recruții de la depozitul de recruți al Corpului de Infanterie Marină din San Diego, aflat în apropiere, petrec patru săptămâni la poligonul Edson Range de la Pendleton, primind pregătire pe teren; după absolvirea stagiului de recruți, pușcașii marini nou-veniți se întorc la Școala de Infanterie a bazei pentru pregătire suplimentară.
Camp Pendleton rămâne ultima porțiune majoră nedezvoltată a coastei californiene la sud de Santa Barbara, cu excepția câtorva parcuri de stat relativ mici. În 2015, situl a fost propus pentru un aeroport civil de mari dimensiuni.
Din august 2004, Camp Pendleton a fost una dintre cele cinci locații din cadrul Departamentului Apărării care operează radarul aerian Standard Terminal Automation Replacement System (STARS). Radarul STARS permite instalației să simuleze traficul aerian în scopuri de instruire.
Camp Pendleton’s five-man color guard a participat la multe evenimente sportive din San Diego și la Convenția Națională Republicană din 1996, însoțind interpreții imnului național. Printre cei mai faimoși interpreți care au fost însoțiți de garda de culoare de la Camp Pendleton s-au numărat Frankie Laine, Herb Alpert, Wilson Phillips, Jewel, Trisha Yearwood și Dixie Chicks, toți cei care au interpretat imnul național fie la un meci din World Series, fie la Super Bowl, fie, în cazul lui Wilson Phillips, la un meci All-Star Game din Major League Baseball care s-a jucat pe ceea ce este acum stadionul SDCCU.
Într-o scrisoare din 2002 adresată Agenției de Protecție a Mediului din Statele Unite, comandantul Corpului Pușcașilor Marini, J.L. Jones, a declarat pentru Transportation Corridor Agencies (TCA), care operează drumurile cu taxă din Orange County: „Sincer, preferința mea este ca drumul cu taxă propus să nu fie construit pe sau în apropierea Camp Pendleton. Această construcție este încă o aventură de invadare care va îngreuna capacitatea de a ne pregăti pentru război. De asemenea, va duce la pierderi suplimentare de zone naturale care adăpostesc specii pe cale de dispariție, punând astfel o povară și mai mare pe Camp Pendleton pentru a proteja biodiversitatea regiunii.” În 2008, după respingerea, din motive de mediu, a propunerii de extindere a drumului cu taxă SR 241 prin San Onofre State Beach Park, TCA a depus o cerere de autorizare pentru a construi în partea de nord-vest a bazei. Un purtător de cuvânt al Camp Pendleton a respins cererea în 2010, declarând că nu putea permite ca drumul cu taxă să treacă decât prin San Onofre State Beach Park, deoarece misiunile lor de antrenament nu puteau fi îndeplinite fără terenul propus. De fapt, pe porțiunea de nord-vest a bazei locuiește California gnatcatcher, o specie pe cale de dispariție. TCA a finanțat un studiu în 2013 pentru a elimina gnatcatcherul californian de pe lista speciilor pe cale de dispariție, ceea ce ar fi facilitat negocierea construcției și planificarea extinderii 241 prin San Onofre State Beach Park.