Montreal Canadiens și St. Louis BluesEdit
Halák a jucat pentru Hamilton Bulldogs din Liga Americană de Hochei (AHL) în sezonul 2006-2007, înainte de a fi convocat la echipa-mamă din Liga Națională de Hochei (NHL), Montreal Canadiens, la 15 februarie 2007, după o accidentare a portarului titular al lui Canadiens, Cristobal Huet. La momentul convocării sale, Halák avea o medie de 2,00 goluri contra (GAA) cu Bulldogs, cea mai mică din AHL. A jucat primul său meci în NHL la 18 februarie 2007, oprind 31 de aruncări într-o victorie cu 3-2 în fața lui Columbus Blue Jackets. Halák a obținut primul său „shutout” din carieră în NHL la 20 martie 2007, reușind 30 de parade pentru a ține departe de tabela de marcaj pe rivalii de la Canadiens, Boston Bruins, cu o victorie cu 1-0.
Halák a fost repartizat la Bulldogs pentru cea mai mare parte a sezonului 2007-08. Cu toate acestea, după ce Canadiens l-a tranzacționat pe Huet la 26 februarie 2008, Halák a preluat cu normă întreagă funcția de portar de rezervă al lui Canadiens. El a început primul său meci din playoff la 30 aprilie 2008 împotriva celor de la Philadelphia Flyers (o înfrângere cu 4-2), după o prestație sub așteptări a noului titular Carey Price, care a preluat din nou conducerea în următorul meci. A îndeplinit sarcini de rezervă pentru Canadiens până în sezonul următor. Cu toate acestea, jocul puternic al lui Halák, coroborat cu performanțele inconstante ale lui Price, a dus la o oportunitate pentru Halák de a intra într-un rol mai important. În cele din urmă, pe baza jocului său puternic pentru Canadiens și pentru Slovacia la Jocurile Olimpice de la Vancouver, a existat o presiune internă puternică pentru a-l desemna pe Halák portarul titular al echipei. Halák a continuat să fie numit jucătorul anului la Cupa Molson al sezonului pentru Canadiens și a fost desemnat titular în meciul din prima rundă a playoff-ului împotriva echipei Washington Capitals, câștigătoare a Trofeului Președintelui. În cel de-al șaselea meci al seriei, Halák a oprit 53 de aruncări, stabilind un record al clubului pentru un meci din playoff (în timpul regulamentar), conducându-i pe Canadiens la o victorie cu 4-1. În cele din urmă, Canadiens au depășit un deficit de 3-1 și au câștigat seria în șapte meciuri, marcând una dintre cele mai mari surprize din istoria NHL. Victoria a fost atribuită în mare parte jocului lui Halák, care a respins 131 din cele 134 de aruncări ale lui Washington în meciurile 5-7, frustrând cea mai bună echipă marcatoare din liga din sezonul regulat. După ce a învins Pittsburgh Penguins în șapte meciuri, Canadiens a căzut în fața celor de la Philadelphia Flyers în finala Conferinței de Est, cu o înfrângere de 4-1 în serie.
La încheierea sezonului, atât Halák, cât și Price au devenit agenți liberi restricționați, iar la Montreal a apărut o mare dezbatere pe tema portarilor despre cine va rămâne la echipă, Halák, eroul din playoff, sau mai tânărul Price. După săptămâni de speculații în presă, Canadiens l-au ales pe Price și, la 17 iunie, l-au cedat în mod controversat pe Halák la St. Louis Blues în schimbul a doi jucători de perspectivă, centrul Lars Eller și aripa dreaptă Ian Schultz. La 6 iulie 2010, Halák a semnat un contract pe patru ani în valoare de 15 milioane de dolari cu Blues. Înainte de sezonul 2010-2011, Halák a organizat o sesiune de autografe la Montreal ca gest de adio și de bunăvoință, pentru a le mulțumi fanilor pentru sprijinul lor, precum și pentru a strânge fonduri pentru Spitalul de copii Ste-Justine din Montreal. Deși erau așteptați 500 de fani, peste 5.000 de fani au participat la evenimentul organizat la mall-ul Fairview Pointe-Claire, ceea ce atestă popularitatea sa în rândul fanilor lui Canadiens.
Halák a jucat primul său meci cu Blues pe 9 octombrie 2010, obținând o victorie cu 2-1 în fața lui Flyers. Halák avea să obțină primul său shutout cu echipa pe 23 octombrie 2010, acasă, împotriva celor de la Penguins, oprind 31 de aruncări într-o victorie cu 1-0 în prelungiri. Halák a avut un start rapid, având 8-1-1 și avea să împartă rolul de titular cu Brian Elliott pentru restul sezonului. În sezonul 2011-12, Halák și Elliott au primit trofeul William M. Jennings Trophy pentru că au permis cele mai puține goluri (165 colectiv) în sezonul regulat.
Tranzacții și New York IslandersEdit
Înainte de termenul limită de tranzacționare 2013-14, Blues i-a tranzacționat pe Halák, Chris Stewart, William Carrier, o alegere din prima rundă în 2015 și o alegere condiționată din a treia rundă în 2014 către Buffalo Sabres în schimbul lui Ryan Miller și Steve Ott la 28 februarie 2014. Halák nu a jucat niciun meci pentru Sabres și, în cele din urmă, a fost cedat împreună cu o selecție din turul al treilea la Washington Capitals în schimbul lui Michal Neuvirth și Rostislav Klesla la termenul limită de tranzacționare. Halák a jucat pentru Sabres în calitate de portar de rezervă într-un singur meci, devenind astfel al 10-lea jucător din istoria Sabres care a îmbrăcat echipamentul echipei într-un meci din sezonul regulat, dar nu a jucat.
În calitate de agent liber nerestricționat în așteptare, drepturile lui Halák au fost tranzacționate de Capitals la New York Islanders la 1 mai 2014 pentru o alegere din runda a patra la draftul din 2014. La 22 mai 2014, Islanders a semnat cu el un contract pe patru ani în valoare de 18 milioane de dolari. La 4 decembrie 2014, Islanders a învins pe Ottawa Senators, Halák obținând a 11-a victorie consecutivă și stabilind un record al francizei deținut anterior de Billy Smith, care a câștigat 10 meciuri consecutive. La 15 ianuarie 2015, a fost numit în NHL All Star Game 2015 ca înlocuitor de accidentare al portarului Pekka Rinne de la Nashville Predators, marcând astfel prima sa apariție în NHL All-Star. La meci, a jucat pentru echipa căpitanului Jonathan Toews de la Chicago Blackhawks și a oprit șase din zece aruncări în a treia repriză, în timp ce el, coechipierul său de la Islanders, John Tavares, și echipa Toews au câștigat meciul cu un scor record de 17-12. La 19 februarie 2015, a egalat recordul francizei Islanders pentru cele mai multe victorii într-un sezon, reușind cea de-a 32-a victorie, într-o victorie cu 5-2 împotriva celor de la Predators. Opt zile mai târziu, pe 27 februarie, a stabilit un nou record al francizei, înregistrând a 33-a victorie a sezonului, într-o victorie cu 2-1 împotriva lui Calgary Flames.
În martie 2016, Halák a suferit o accidentare la nivelul părții inferioare a corpului și a ratat restul sezonului, Thomas Greiss înlocuindu-l pe durata accidentării. În timpul sezonului 2016-17, la 30 decembrie 2016, Halák a fost plasat pe waivers. A doua zi, el a fost repartizat la Bridgeport Sound Tigers din American Hockey League (AHL).
Boston BruinsEdit
După ce și-a încheiat contractul de patru ani cu Islanders, Halák a plecat ca agent liber pentru a semna un contract de doi ani și 5,5 milioane de dolari cu Boston Bruins la 1 iulie 2018. Halak a jucat în primul meci ca membru al lui Bruins pe 4 octombrie 2018, într-o victorie cu 4-0 în fața lui Buffalo Sabres. Halák a revenit în Long Island pe 19 martie și a avut parte de un videoclip omagial difuzat pentru el, împreună cu o ovație în picioare din partea fanilor prezenți. El a încheiat sezonul cu 22 de victorii și 5 shutout-uri în 40 de meciuri în total.
La 1 mai 2020, Bruins a semnat cu Halák o prelungire de contract pe un an și 2,25 milioane de dolari.
În timpul sezonului scurtat 2019-20, Halák a câștigat al doilea său Trofeu Jennings, câștigându-l alături de Tuukka Rask. Halák a avut 18 victorii și 3 eliminări în 31 de meciuri în total.
La 15 august 2020, înainte de meciul 3 din playoff-ul Cupei Stanley împotriva celor de la Carolina Hurricanes, portarul lui Bruins, Tuukka Rask, a optat să renunțe la restul playoff-ului și a părăsit „bula” Toronto. Halák a fost numit titular și a câștigat cu 3-1 primul său meci din carieră în playoff ca Bruin. Halak a continuat să câștige următoarele două meciuri din playoff și a condus Bruins la o victorie cu 4-1 în seria cu Carolina.
.