Fibromyalgie se vyskytuje v rodinách. O genetickém základu fibromyalgie je však známo jen málo jistých informací. Je pravděpodobné, že se kombinují odchylky v mnoha genech, z nichž každý má malý vliv, a zvyšují tak riziko vzniku tohoto onemocnění.
Příznaky a symptomy fibromyalgie souvisejí se způsobem, jakým mozek rozpoznává a interpretuje signály bolesti. Lidé s fibromyalgií mají zvýšenou citlivost na bolest; v reakci na daný podnět pociťují bolest ostřeji než ostatní. Vědci tento jev popisují jako příliš vysokou „hlasitost“ bolestivých vjemů (zesílení bolesti). Studie genetiky fibromyalgie se zaměřily na geny, které hrají roli ve způsobu, jakým mozek zpracovává bolest. Například několik genů, které mohou mít vliv na toto onemocnění, se podílí na produkci a odbourávání určitých chemických poslů zvaných neurotransmitery
. Tyto chemické látky přenášejí signály mezi nervovými buňkami, které mohou zvýšit nebo snížit pocit bolesti, což je proces známý jako modulace bolesti.
Negenetické (environmentální) faktory také hrají rozhodující roli v riziku vzniku fibromyalgie u člověka. Poruchu může vyvolat infekce nebo nemoc, která by jinak chronickou bolest nezpůsobila, zranění a jiná fyzická zátěž. Psychologické a sociální faktory, jako je zneužívání nebo zanedbávání v dětství, vystavení válce nebo jiným katastrofickým událostem a nízká spokojenost s prací nebo životem, jsou rovněž spojeny se zvýšeným rizikem vzniku fibromyalgie. Kromě toho se zdá, že riziko zvyšuje fyzická nečinnost, obezita a poruchy spánku. Mnoho lidí, u nichž se toto onemocnění vyvine, však nemá žádné rozpoznané spouštěcí nebo rizikové faktory. Je pravděpodobné, že podmínky prostředí spolupůsobí s genetickými faktory a určují celkové riziko vzniku této poruchy.