Haplotyp

Další jazyky:
Angličtina

Haplotyp (známý také jako podpis, DNA podpis nebo genetický podpis) je soubor markerů (polymorfismů) na jednom chromozomu, které se obvykle dědí společně. Haplotyp se může vztahovat ke kombinaci alel nebo k souboru jednonukleotidových polymorfismů (SNP). Haplotyp je zkratkou termínu haploidní genotyp.

V genetické genealogii se tento termín obvykle používá pro písmena nebo čísla získaná z výsledků genealogického testu DNA. Haplotypy se mohou skládat z různého počtu markerů v závislosti na provedeném testu, a proto existují v různém rozlišení.

Kdykoli se používá termín haplotyp nebo signatura, je vhodné objasnit zamýšlený význam v kontextu, ve kterém se používá.

Haplotyp Y-DNA

V kontextu výsledků testů DNA chromozomu Y se haplotyp obvykle vztahuje na hodnoty markerů (alel) získané z testu Y-STR (krátké tandemové repetice). Výsledek pro každý marker je vyjádřen číslem.

V projektech DNA příjmení může termín odkazovat na individuální, skupinový nebo modální haplotyp či signaturu.

mtDNA haplotyp

MtDNA haplotyp označuje výsledky získané z testu mitochondriální DNA. Výsledky se porovnávají buď s revidovanou referenční sekvencí Cambridge, nebo s rekonstruovanou referenční sekvencí Sapiens. Uvádějí se písmena nebo báze DNA, které se liší od referenční sekvence.

  • Definice haplotypu v tabulce SciTable
  • Článek o haplotypu na Wikipedii
  • Haplotyp versus haploskupina – rozdíl mezi haploskupinou & haplotypem vysvětlil Charles Kerchner.
  • Měření vzácnosti haplotypu Rozšířená esej Ralpha Taylora, správce projektu Taylor DNA
  • Stabilita haplotypu od Ralpha Taylora

Zdroje

Zdroje použité k sestavení této definice zahrnují:

  • Slovník SNP stromů ISOGG.
  • Talking Glossary of Genetic Terms from the National Human Genome Research Institute.
  • Aulicino E. Genetic Genealogy; The Basics and Beyond. Author House, 2013, p245.
  • Kennett D. DNA and Social Networking. Stroud, Gloucestershire: The History Press, 2011, p211.
  • Pomery C. Family History in the Genes. London: The National Archives, p225.
  • Smolenyak M, Turner A. Trace Your Roots with DNA. Rodale Inc, 2004. p253.

See also

  • Ancestral haplotype
  • DNA databases
  • Haplogroup
  • Match
  • Modal haplotype
  • Western Atlantic Modal Haplotype

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.