Haplotyp (známý také jako podpis, DNA podpis nebo genetický podpis) je soubor markerů (polymorfismů) na jednom chromozomu, které se obvykle dědí společně. Haplotyp se může vztahovat ke kombinaci alel nebo k souboru jednonukleotidových polymorfismů (SNP). Haplotyp je zkratkou termínu haploidní genotyp.
V genetické genealogii se tento termín obvykle používá pro písmena nebo čísla získaná z výsledků genealogického testu DNA. Haplotypy se mohou skládat z různého počtu markerů v závislosti na provedeném testu, a proto existují v různém rozlišení.
Kdykoli se používá termín haplotyp nebo signatura, je vhodné objasnit zamýšlený význam v kontextu, ve kterém se používá.
Haplotyp Y-DNA
V kontextu výsledků testů DNA chromozomu Y se haplotyp obvykle vztahuje na hodnoty markerů (alel) získané z testu Y-STR (krátké tandemové repetice). Výsledek pro každý marker je vyjádřen číslem.
V projektech DNA příjmení může termín odkazovat na individuální, skupinový nebo modální haplotyp či signaturu.
mtDNA haplotyp
MtDNA haplotyp označuje výsledky získané z testu mitochondriální DNA. Výsledky se porovnávají buď s revidovanou referenční sekvencí Cambridge, nebo s rekonstruovanou referenční sekvencí Sapiens. Uvádějí se písmena nebo báze DNA, které se liší od referenční sekvence.
- Definice haplotypu v tabulce SciTable
- Článek o haplotypu na Wikipedii
- Haplotyp versus haploskupina – rozdíl mezi haploskupinou & haplotypem vysvětlil Charles Kerchner.
- Měření vzácnosti haplotypu Rozšířená esej Ralpha Taylora, správce projektu Taylor DNA
- Stabilita haplotypu od Ralpha Taylora
Zdroje
Zdroje použité k sestavení této definice zahrnují:
- Slovník SNP stromů ISOGG.
- Talking Glossary of Genetic Terms from the National Human Genome Research Institute.
- Aulicino E. Genetic Genealogy; The Basics and Beyond. Author House, 2013, p245.
- Kennett D. DNA and Social Networking. Stroud, Gloucestershire: The History Press, 2011, p211.
- Pomery C. Family History in the Genes. London: The National Archives, p225.
- Smolenyak M, Turner A. Trace Your Roots with DNA. Rodale Inc, 2004. p253.
See also
- Ancestral haplotype
- DNA databases
- Haplogroup
- Match
- Modal haplotype
- Western Atlantic Modal Haplotype