Jaterní cysty se vyskytují přibližně u 5 % populace. Pouze u 5 % těchto pacientů se však někdy objeví příznaky. Obecně jsou cysty tenkostěnné struktury, které obsahují tekutinu. Většina cyst je jednotlivá, i když někteří pacienti jich mohou mít několik. Mezi příznaky spojené s jaterními cystami patří plnost v horní části břicha, nepříjemné pocity nebo bolest. U malého počtu pacientů dochází ke krvácení do cysty, které způsobuje náhlou a silnou bolest v pravém horním kvadrantu a rameni. Krvácení se samo zastaví a bolest se pak během několika následujících dnů zlepší. Jaterní cysty nenarušují schopnost jater fungovat. Cysty se obvykle zjistí pomocí ultrazvuku (USG) nebo počítačové tomografie (CT). Jednoduché jaterní cysty jsou vždy nezhoubné. Léčbu jaterní cysty (cyst) vyžadují pouze pacienti, u kterých se objeví příznaky. Pouhé odstranění tekutiny z cysty jehlou není účinné, protože cysta se během několika dnů opět naplní. Nejlepší léčbou je odstranění velké části stěny cysty. Tento chirurgický zákrok lze obvykle provést pomocí laparoskopu, což vyžaduje pouze 2-3 malé řezy a pobyt v nemocnici přes noc. Většina pacientů se plně zotaví do 2 týdnů. Riziko opakovaného výskytu cysty je velmi nízké. Velmi malý počet pacientů (0,6 % celkové populace) trpí polycystickým onemocněním jater (PLD), které se vyznačuje tím, že játra vypadají jako shluk velmi velkých hroznů. U pacientů s PLD může v průběhu několika let dojít k masivnímu zvětšení jater, které má za následek otoky břicha a nepříjemné pocity. V extrémních případech může mít pacient kvůli bolesti a tekutině velmi špatnou kvalitu života. Na rozdíl od nevyhnutelného selhání ledvin spojeného s polycystickým onemocněním ledvin, které může s PLD koexistovat, PLD nezpůsobuje selhání jater. Jediným dlouhodobým řešením pro pacienty s těžkou PLD je transplantace jater.
Cystické nádory
Na rozdíl od prostých jaterních cyst jsou cystické nádory vlastně výrůstky, které se v průběhu mnoha let mohou stát zhoubnými. Nejčastěji se vyskytující nezhoubný cystický nádor se nazývá cystadenom; jeho zhoubný protějšek je cystadenokarcinom. Příznaky způsobené cystickými nádory jsou stejné jako u prostých cyst: plnost, nepohodlí a bolest. Jaterní krevní testy obvykle zůstávají normální, pokud nedošlo k rozvoji rakoviny. USG a CT jsou nejlepšími zobrazovacími vyšetřeními k zobrazení cystických nádorů, které obsahují jak tekuté, tak pevné oblasti. Vzhledem k možnosti vzniku zhoubného nádoru musí být cystické nádory kompletně odstraněny chirurgicky otevřenou (nikoli laparoskopickou) operací. Míra recidivy po operaci je velmi nízká a dlouhodobá prognóza je vynikající.