Las correlaciones entre los sitios de mutación de la línea germinal APC y los patofenotipos colorrectales, evaluados por el recuento directo de adenomas en la colectomía, se investigaron analizando especímenes de colectomía de 29 pacientes con PAF que portaban una mutación con sentido erróneo (codón 208) y 14 mutaciones de APC con cambio de marco o sin sentido (codones 232, 367, 437, 623, 876, 995, 1061, 1068, 1075, 1112, 1114, 1309, 1324, 1556). La mutación con sentido erróneo en el codón 208 se asoció a un fenotipo colorrectal relativamente leve. La mutación en el codón 367, sujeta a splicing alternativo, se asoció a una PAF atenuada. La mutación en el codón 1309 se asoció con la adenomatosis colorrectal profusa. En el caso de 13 mutaciones, que se prevé que den lugar a alelos nulos o a proteínas APC truncadas, correlacionamos la densidad y la distribución de los adenomas colorrectales con los efectos funcionales previstos de la mutación. El patofenotipo colorrectal más grave se asoció significativamente con la mutación truncadora en el codón 1309, que se encuentra aguas abajo del dominio de unión a la beta-catenina I pero aguas arriba del dominio de unión a la beta-catenina II. Las mutaciones entre los codones 867 y 1114, que afectan al dominio de unión a beta-catenina I, así como las mutaciones que se producen en los exones 6 y 9, que se prevé que den lugar a alelos nulos, se asociaron con un fenotipo colorrectal menos grave. En general, el mayor número de adenomas se detectó en el colon derecho, seguido del colon izquierdo, el colon transverso sigma y el recto. Sin embargo, la mayor densidad de adenomas se observó en el colon izquierdo, seguido del colon derecho, el sigma, el colon transverso y el recto. Los carcinomas colorrectales, observados en sólo cinco pacientes, estaban todos en el colon izquierdo.