Correlações entre locais de mutação APC na linha germinal e patofenótipos colorretais, conforme avaliado pela contagem direta de adenomas na colectomia, foram investigadas peças de colectomia de 29 pacientes portadores de PAF com um erro de sentido (códon 208) e 14 mutações APC de mudança de quadro ou sem sentido (códons 232, 367, 437, 623, 876, 995, 1061, 1068, 1075, 1112, 1114, 1309, 1324, 1556). A mutação de sentido errado no códão 208 foi associada a um patofenótipo colorretal relativamente leve. A mutação no códon 367, sujeita a emendas alternativas, foi associada à PAF atenuada. A mutação no códon 1309 foi associada à adenomatose colorretal profusa. Para 13 mutações, previstas para resultar em alelos nulos ou proteínas APC truncadas, correlacionamos densidade e distribuição dos adenomas colorretais com os efeitos funcionais previstos da mutação. O patofenótipo colorretal mais grave foi significativamente associado com a mutação truncante no códon 1309, que está localizado abaixo do domínio de ligação beta-catenina I, mas acima do domínio de ligação beta-catenina II. Mutações entre os códons 867 e 1114, que afetam o domínio I de ligação beta-catenina, assim como mutações que ocorrem nos exons 6 e 9, previstas para resultar em alelos nulos, foram associadas a um patofenótipo colorretal menos severo. Em geral, o maior número de adenomas foi detectado no cólon direito, seguido pelo cólon esquerdo, cólon transverso sigma e reto. No entanto, a maior densidade de adenomas foi observada no cólon esquerdo, seguido pelo cólon direito, sigma, cólon transverso e reto. Os carcinomas colorretais, observados em apenas cinco pacientes, estavam todos no cólon esquerdo.