NMC oglądane pod mikroskopem są słabo zróżnicowanymi rakami, które wykazują nagłe przejścia do wysp dobrze zróżnicowanego nabłonka płaskiego. Ten wzór nowotworu nie jest specyficzny ani unikalny dla raka linii środkowej NUT, ale ten wzór jest najbardziej sugerujący diagnozę. Komórki nowotworowe będą wykazywać pozytywną reakcję z różnymi cytokeratynami, p63, CEA i CD34 immunohistochemicznie. Jednakże przeciwciało NUT potwierdza diagnozę (chociaż jest dostępne tylko w ograniczonej liczbie laboratoriów).
Diagnostyka różnicowaEdit
Diagnostyka różnicowa jest dość szeroka, ale ważne jest, aby rozważyć ten typ nowotworu, gdy widzi się słabo zróżnicowany guz, który wykazuje nagłe obszary rogowacenia. Inne guzy uwzględnione w diagnostyce różnicowej to rak niezróżnicowany zatok, mięsak Ewinga/prymitywny guz neuroektodermalny, białaczka, rhabdomyosarcoma i czerniak. Kiedy rak linii środkowej NUT jest widoczny w głowie i szyi, płaska wyściółka jam ciała może być uwięziona przez komórki nowotworowe, dlatego ważne jest udokumentowanie komórek rakowych w pozostałej części guza za pomocą różnych barwników (w tym cytokeratyny lub p63). Jednym z najbardziej pomocnych i charakterystycznych wyników jest ogniskowe, gwałtowne zróżnicowanie płaskonabłonkowe, w którym brak jest stratyfikacji i stopniowego różnicowania, przypominające ciałko Hassalla w grasicy.
Definiującą cechą NMC jest rearanżacja genu NUT.Najczęstszą jest translokacja obejmująca gen BRD4 i gen NUT (t(15;19)(q13;p13.1)).