Walka wyzwoleńcza w Tanganice była prowadzona przez Tanganikańską Afrykańską Unię Narodową, której flagą była pozioma trójkolorowa flaga zielono-czarno-zielona. Wybory potwierdziły ogromne poparcie społeczne dla organizacji, a władze brytyjskie zasugerowały modyfikację flagi partyjnej w celu wykorzystania jej jako flagi narodowej po uzyskaniu niepodległości 9 grudnia 1961 roku. Yellow fimbriations were added at that time.
Under Arab rule Zanzibar had long flawed a red flag, but a black African regime came to power on January 12, 1964, under a flag of black, yellow, and blue. W następnym miesiącu rządząca Partia Afro-Shirazi wprowadziła nową flagę narodową podobną do swojej własnej. Poziome niebiesko-czarno-zielone pasy oznaczały odpowiednio morze, ludzi i ziemię, podczas gdy wąski biały pionowy pasek u góry oznaczał pokój.
W kwietniu 1964 roku kraje Tanganika i Zanzibar zjednoczyły się, a na początku lipca ich tradycje flagowe zostały połączone w nową flagę narodową Tanzanii. Kolory flagi zostały połączone po przekątnej, aby nadać jej wyrazistości. Czarny pas symbolizuje większość ludności kraju, podczas gdy zieleń wskazuje na bogate zasoby rolne ziemi. Bogactwa mineralne są odzwierciedlone w wąskich żółtych granicach, podczas gdy Ocean Indyjski jest symbolizowany przez kolor niebieski. Po zjednoczeniu Zanzibaru z Tanganiką, flaga Zanzibaru nadal była używana lokalnie na tych wyspach.