Korrelationer mellan APC-mutationer och kolorektala patofenotyper, som utvärderades genom det direkta antalet adenom vid kolektomi, undersöktes genom att analysera kolektomiprover från 29 FAP-patienter som bar på en felmening (kodon 208) och 14 ramförskjutningsmutationer eller icke-sense APC-mutationer (kodon 232, 367, 437, 623, 876, 995, 1061, 1068, 1075, 1112, 1114, 1309, 1324, 1556). Missense-mutationen vid kodon 208 var förknippad med en relativt mild kolorektal patofenotyp. Mutationen vid kodon 367, som är föremål för alternativ splicing, var förknippad med mild FAP. Mutationen vid kodon 1309 var förknippad med en kraftig kolorektal adenomatos. För 13 mutationer, som förutspås resultera i nollalleler eller trunkerade APC-proteiner, korrelerade vi täthet och fördelning av kolorektala adenom med de förutspådda funktionella effekterna av mutationen. Den allvarligaste kolorektala patofenotypen var signifikant förknippad med den trunkerande mutationen vid kodon 1309, som är belägen nedströms till I beta-cateninbindningsdomänen men uppströms II beta-cateninbindningsdomänen. Mutationer mellan kodon 867 och 1114, som påverkar I-beta-kateninbindningsdomänen, samt mutationer som förekommer i exon 6 och 9, som förutspås resultera i nollalleler, var associerade med en mindre allvarlig kolorektal patofenotyp. Totalt sett upptäcktes det högsta antalet adenom i höger tjocktarm, följt av vänster tjocktarm, tvärkolon sigma och rektum. Den högsta tätheten av adenom observerades dock i vänster kolon, följt av höger kolon, sigma, tvärkolon och rektum. Kolorektala karcinom, som observerades hos endast fem patienter, fanns alla i vänster kolon.