Haplotyp

Andra språk:
English

En haplotyp (även kallad signatur, DNA-signatur eller genetisk signatur) är en uppsättning markörer (polymorfismer) på en enskild kromosom som tenderar att gå i arv tillsammans. En haplotyp kan avse en kombination av alleler eller en uppsättning enskilda nukleotidpolymorfismer (SNP). Haplotyp är en sammandragning av termen haploid genotyp.

I genetisk genealogi används termen normalt för de bokstäver eller siffror som erhålls från resultaten av ett genealogiskt DNA-test. Haplotyper kan bestå av ett varierande antal markörer beroende på vilket test som tagits och existerar därför i olika upplösningar.

När termen haplotyp eller signatur används är det lämpligt att klargöra den avsedda innebörden i det sammanhang där den används.

Y-DNA haplotyp

I samband med resultat från DNA-test på Y-kromosom avser haplotypen vanligen de markörvärden (allelvärden) som erhålls från ett Y-STR-test (short tandem repeat). Resultatet för varje markör uttrycks som ett tal.

I efternamns-DNA-projekt kan termen hänvisa till en individuell, grupp- eller modal haplotyp eller signatur.

mtDNA haplotype

MtDNA haplotype hänvisar till de resultat som erhålls från ett mitokondriellt DNA-test. Resultaten jämförs antingen med den reviderade Cambridge-referenssekvensen eller den rekonstruerade Sapiens-referenssekvensen. De DNA-bokstäver eller baser som skiljer sig från referenssekvensen rapporteras.

  • SciTable definition av haplotype
  • Wikipedia artikel om haplotype
  • Haplotype versus haplogroup – skillnaden mellan haplogroup & haplotype förklaras av Charles Kerchner.
  • Measuring haplotype rarity An extended essay by Ralph Taylor, administrator of the Taylor DNA Project
  • Haplotype stability by Ralph Taylor

Källor

Källorna som har använts för att sammanställa den här definitionen är:

  • The ISOGG SNP tree glossary.
  • Talking Glossary of Genetic Terms from the National Human Genome Research Institute.
  • Aulicino E. Genetic Genealogy; The Basics and Beyond. Author House, 2013, p245.
  • Kennett D. DNA and Social Networking. Stroud, Gloucestershire: The History Press, 2011, p211.
  • Pomery C. Family History in the Genes. London: The National Archives, p225.
  • Smolenyak M, Turner A. Trace Your Roots with DNA. Rodale Inc, 2004. p253.

See also

  • Ancestral haplotype
  • DNA databases
  • Haplogroup
  • Match
  • Modal haplotype
  • Western Atlantic Modal Haplotype

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.