Montreal Canadiens och St Louis BluesEdit
Halák spelade för Hamilton Bulldogs i American Hockey League (AHL) under säsongen 2006-2007 innan han kallades upp till sitt moderlag i National Hockey League (NHL), Montreal Canadiens, den 15 februari 2007, efter en skada på Canadiens startande målvakt, Cristobal Huet. När Halák kallades in hade han ett målsnitt (GAA) på 2,00 i Bulldogs, vilket var det lägsta i AHL. Han spelade sin första NHL-match den 18 februari 2007 och stoppade 31 skott i en 3-2-seger mot Columbus Blue Jackets. Halák fick sin första shutout i NHL-karriären den 20 mars 2007, då han gjorde trettio räddningar för att hålla Canadiens rival Boston Bruins borta med en 1-0-seger.
Halák var tilldelad Bulldogs för större delen av säsongen 2007/08. Efter att Canadiens bytte Huet den 26 februari 2008 tog Halák dock över på heltid som Canadiens reservmålvakt. Han startade sin första slutspelsmatch den 30 april 2008 mot Philadelphia Flyers (förlust med 4-2) efter undermåliga prestationer från den nyutnämnde startspelaren Carey Price, som återigen tog över i den följande matchen. Han fullgjorde back-up uppgifter för Canadiens under den följande säsongen. Haláks starka spel i kombination med inkonsekventa prestationer från Price ledde dock till en möjlighet för Halák att ta steget in i en större roll. I slutändan, baserat på hans starka spel för Canadiens och för Slovakien vid OS i Vancouver, fanns det ett starkt internt tryck på att utse Halák till lagets startmålvakt. Halák utsågs till årets spelare i Canadiens Molson Cup för säsongen och utsågs till startspelare inför den första slutspelsrundan mot Washington Capitals, som vann President’s Trophy. I den sjätte matchen i serien stoppade Halák 53 skott och satte därmed klubbrekord för en slutspelsmatch (i ordinarie tid) och ledde Canadiens till en 4-1-seger. I slutändan övervann Canadiens ett underläge på 3-1 i serien och vann serien i sju matcher, vilket markerade en av de största överraskningarna i NHL:s historia. Segern tillskrivs till stor del Haláks spel då han avvärjde 131 av Washingtons 134 skott i matcherna 5 till 7, vilket frustrerade ligans poängbästa lag från den ordinarie säsongen. Efter att ha besegrat Pittsburgh Penguins i sju matcher föll Canadiens mot Philadelphia Flyers i Eastern Conference-finalen med en 4-1-serieförlust.
I slutet av säsongen, blev både Halák och Price restricted free agents och en stor målvaktsdebatt uppstod i Montreal om vem som skulle stanna kvar i laget, slutspelshjälten Halák eller den yngre Price. Efter veckor av mediaspekulationer valde Canadiens Price och den 17 juni bytte de kontroversiellt Halák till St Louis Blues i utbyte mot två prospects, centern Lars Eller och högerbacken Ian Schultz. Den 6 juli 2010 skrev Halák på ett fyraårskontrakt på 15 miljoner dollar med Blues. Inför säsongen 2010-11 höll Halák en autografsignering i Montreal som ett avsked och en goodwillgest för att tacka fansen för deras stöd och för att samla in pengar till Montreal Ste-Justine Children’s Hospital. Trots att 500 fans förväntades deltog mer än 5 000 fans i evenemanget som hölls i köpcentret Fairview Pointe-Claire, vilket vittnar om hans popularitet bland Canadiens-fansen.
Halák spelade sin första match med Blues den 9 oktober 2010, med en 2-1-seger mot Flyers. Halák skulle få sin första shutout med laget den 23 oktober 2010 hemma mot Penguins och stoppade 31 skott i en 1-0 övertidsseger. Halák fick en snabb start med 8-1-1 och skulle dela startelvan med Brian Elliott under resten av säsongen. Under säsongen 2011-12 tilldelades Halák och Elliott William M. Jennings Trophy för att ha släppt in minst antal mål (165 tillsammans) under den ordinarie säsongen.
Trades and New York IslandersEdit
För 2013-14 års deadline för byteshandel bytte Blues Halák, Chris Stewart, William Carrier, ett första-omgångs draftval 2015 och ett villkorligt tredje-omgångs draftval 2014 till Buffalo Sabres i utbyte mot Ryan Miller och Steve Ott den 28 februari 2014. Halák deltog inte i någon match för Sabres och såldes slutligen tillsammans med ett draftval i tredje rundan till Washington Capitals i utbyte mot Michal Neuvirth och Rostislav Klesla vid trade deadline. Halák spelade för Sabres som reservmålvakt i en match, vilket gjorde honom till den tionde spelaren i Sabres historia som spelade för laget i en ordinarie säsongsmatch men inte spelade.
Som väntande obegränsad fri agent byttes Haláks rättigheter av Capitals till New York Islanders den 1 maj 2014 för ett val i fjärde rundan i 2014 års draft. Den 22 maj 2014 skrev Islanders på honom ett fyraårskontrakt värt 18 miljoner dollar. Den 4 december 2014 besegrade Islanders Ottawa Senators, där Halák vann sin elfte raka seger och satte ett franchise-rekord som tidigare innehades av Billy Smith, som vann 10 raka matcher. Den 15 januari 2015 utsågs han till 2015 års NHL All Star Game som skadeersättare för Nashville Predators målvakt Pekka Rinne, vilket innebar hans första framträdande i NHL All Star. Vid matchen spelade han för laget som leddes av Chicago Blackhawks Jonathan Toews och stoppade sex av tio skott i den tredje perioden när han, Islanders lagkamrat John Tavares och Team Toews vann matchen med ett rekordstort resultat på 17-12. Den 19 februari 2015 tangerade han Islanders’ franchiserekord för flest segrar under en säsong, med sin 32:a seger i en 5-2-seger mot Predators. Åtta dagar senare, den 27 februari, satte han ett nytt franchise-rekord genom att registrera sin 33:e seger för säsongen i en 2-1-seger mot Calgary Flames.
I mars 2016 drabbades Halák av en skada i nedre delen av kroppen och missade resten av säsongen, och Thomas Greiss hoppade in under skadan. Under säsongen 2016-17, den 30 december 2016, placerades Halák på waivers. Dagen efter tilldelades han Bridgeport Sound Tigers i American Hockey League (AHL).
Boston BruinsEdit
Efter att ha fullföljt sitt fyraårskontrakt med Islanders lämnade Halák som fri agent för att skriva ett tvåårskontrakt på 5,5 miljoner dollar med Boston Bruins den 1 juli 2018. Halák spelade sin första start som medlem i Bruins den 4 oktober 2018 i en 4-0 shutoutvinst mot Buffalo Sabres. Halák gjorde sin återkomst till Long Island den 19 mars och fick en hyllningsvideo spelad för sig tillsammans med en stående ovation från de närvarande fansen. Han avslutade säsongen med 22 segrar och 5 shutouts på totalt 40 matcher.
Den 1 maj 2020 skrev Bruins på Halák en ettårig kontraktsförlängning på 2,25 miljoner dollar.
Under den förkortade säsongen 2019-20 vann Halák sin andra Jennings Trophy och vann den tillsammans med Tuukka Rask. Halák hade 18 segrar och 3 shutouts på totalt 31 matcher.
Den 15 augusti 2020, inför match 3 i Stanley Cup-slutspelet mot Carolina Hurricanes, valde Bruins målvakt Tuukka Rask att avstå från resten av slutspelet och lämnade Torontos ”bubbla”. Halák utsågs till startspelare och vann sin första slutspelsstart i karriären som Bruin med 3-1. Halak fortsatte att vinna sina två följande slutspelsstarter och ledde Bruins till en 4-1 serieseger över Carolina.