Sedan de banbrytande fynden som involverade PAG och smärtlindring blev PAG ändå mest känt för sin roll i smärtlindring. Även om detta har varit en erkänd funktion hos PAG i flera decennier, är den fullständiga komplexiteten hos den mekanism som ligger till grund för PAG-faciliterad analgesi fortfarande inte helt klarlagd. Den viktigaste vägen tycks inbegripa neuroner som projicerar från PAG till kärnor i märgen – främst raphe-kärnorna, som är grupper av serotoninproducerande neuroner. Aktiverade raphe-neuroner projicerar ner till ryggmärgen där de hämmar neuroner i ryggmärgens dorsalhorn som är ansvariga för att överföra smärtsignaler. Denna väg verkar vara involverad i en mängd olika smärthämmande reaktioner, inklusive analgesi som upplevs under akut stressande händelser och den smärtlindring som vi får genom att ta opioida smärtstillande medel.
Intresset för PAG:s roll i smärtinhibering har lett till att de andra kända funktionerna hos PAG ofta har förbisetts, men det är dock uppenbart att PAG är involverat i mycket mer än bara analgesi. Till exempel verkar PAG spela en roll i regleringen av hjärtfrekvens och blodtryck, och man tror att PAG kan bidra till att justera den kardiovaskulära aktiviteten i samband med särskilda känslomässiga upplevelser. PAG verkar också bidra till ett antal andra autonoma processer, och den är viktig för kontroll och sammandragning av blåsan hos människor och andra djur. PAG spelar en roll i produktionen av vokaliseringar; stimulering av PAG kan framkalla vokaliseringar hos djur och skador på PAG kan störa dem hos människor och andra djur. I ett försök att förstå PAG:s bidrag till vokaliseringar har vissa antagit att PAG är viktigt för att samordna andnings- och larynxmotoriska mönster som underlättar produktionen av vokaliseringar. PAG verkar också vara inblandat i känslomässiga reaktioner. Det verkar vara särskilt troligt att den har inflytande på produktionen av räddhågade och defensiva reaktioner, eftersom stimulering av PAG kan framkalla dessa typer av reaktioner hos en rad olika djur; mänskliga deltagare uppvisade också en aktivering av PAG när ett hot kom närmare dem.
Det finns fortfarande många andra funktioner som är förknippade med PAG och som inte har nämnts här. Trots att PAG är ett relativt litet område i hjärnan är det alltså tätt sammankopplat med olika andra hjärnregioner och verkar vara involverat i en mängd olika funktioner. Det är därför förståeligt varför vissa forskare anser att det är representativt för ett begränsat perspektiv på PAG att kalla det för ett ”analgetikacenter”.