多額の借金を抱えたケンタッキー州の農夫アーサー・シェルビーは、所有するものすべてを失うという事態に直面します。 そんな中、シェルビーは2人の奴隷を粗暴な奴隷商人ヘイリーに売り、資金を調達することを決意する。 その奴隷とは、農場に妻子を持つ中年男のトムおじさんと、シェルビー夫人のメイド、イライザの幼い息子ハリーである。 しかし、シェルビーと妻の会話を聞いてしまったイライザは、トムおじさんと妻のクロエおばさんに警告した後、ハリーを連れて北へ逃げ、カナダで夫のジョージと自由を得ようとします。 ヘイリーが彼女を追いかけるが、他の2人のシェルビーの奴隷がイライザに危険を知らせる。 彼女は奇跡的に捕まることなく、ケンタッキー州と北部を隔てる境界線である、半分凍ったオハイオ川を渡る。 ヘーリーは奴隷狩りの名人ローカーとその一味を雇い、イライザとハリーをケンタッキーに連れ帰る。 イライザとハリーはクエーカー教徒の集落に向かい、そこでクエーカー教徒は彼らを安全に移送する手助けをすることに同意する。 そのため、”崖っぷち “と呼ばれることもあり、”崖っぷち “と呼ばれることもあります。 その船上で、トムはエヴァという天使のような白人の少女に出会い、すぐに仲良くなる。 エヴァが川に落ちたとき、トムは飛び込んで彼女を助け、彼女の父親であるオーガスティン・セントクレアは、ありがたいことにヘイリーからトムを買い取ることに同意する。
北の大地では、ジョージとイライザがローカーとその部下たちから逃れ続けている。 ローカーが二人を捕らえようとしたとき、ジョージは彼の脇腹を撃ち、他の奴隷狩りは退却する。 イライザはジョージとクエーカー教徒に、ロカーを次の開拓地に連れて行き、そこで治療を受けるよう説得する。 一方、ニューオリンズでは、セント・クレアが従兄弟のオフィーリアと奴隷制度について話し合う。彼は制度としての奴隷制度には反対だが、黒人に対して深い偏見を抱いていた。 一方、セント・クレアは、黒人に対して敵意を抱くことはないが、奴隷制度を変えることはできないと感じ、奴隷制度を容認している。
トムがセント・クレア家で2年間暮らした後、エバが重い病気にかかる。
トムが聖クララで2年間暮らした後、エヴァは重い病気にかかり、徐々に衰弱し、天国の幻影を前にして息を引き取る。 彼女の死は、彼女を知るすべての人に大きな影響を与える。 オフィーリアは奴隷を愛することを決意し、トプシーは他人を信頼し愛着を持つことを学び、聖クレアはトムを自由にしようと決心する。 しかし、その決意を実行に移す前に、セント・クレアは喧嘩の仲裁に入ったところを刺し殺されてしまう。
聖クレアの冷酷な妻マリーは、トムを悪徳農園経営者サイモン・レグリーに売り渡す。
聖クレアの残酷な妻マリーは、トムを悪質な農園主サイモン・レグリーに売る。トムは、彼のpresex奴隷カッシーに代わって、悪魔のレグリーが性奴隷として使うために購入したエメリンなどの新しい奴隷のグループとルイジアナの田舎に連れて行かれる。 レグリーは、トムが命令通りに仲間の奴隷を鞭打つことを拒否したことから、トムを強く憎むようになる。 トムは激しい殴打を受け、レグリーは彼の神への信仰を打ち砕くことを決意する。 トムはカッシーに会い、彼女の話を聞く。
その頃、トム・ローカーの助けを借りて、ジョージ、イライザ、ハリーはエリー湖からカナダに渡り、自由を手に入れるが、トムは苦難の末に信仰を捨て去る。 しかし、2つの幻影を見た。1つはキリスト、もう1つはエバ。 エメリンと一緒に幽霊のふりをする策略を練ったカッシーは、エメリンを連れて脱出する。 トムがレグリーにカッシーとエメリンの行方を教えるのを拒むと、レグリーは監督たちに彼を殴るよう命じる。 死期が迫ったトムは、レグリーと監督たちを許す。 ジョージ・シェルビーは、トムの自由を買い取ろうと金を手にやってくるが、遅すぎた。
自由を手にするため船に乗ったカッシーとエメリンは、ジョージの妹と出会い、一緒にカナダへ向かうが、そこでカッシーはイライザが自分の失踪した娘であることに気づく。 フランスに渡った一家は、元アメリカ人奴隷のために作られたアフリカの国、リベリアに移住することを決める。 ジョージ・シェルビーはケンタッキー州の農場に戻り、父の死後、トムの思い出に敬意を表してすべての奴隷を解放する。 そして、トムの小屋を見るたびにトムの犠牲を思い、トムのように敬虔なクリスチャン・ライフを送るよう勧めるのだった。